Linux Conda安装 Github R包

  • 打开终端 (R-4.3.3)

激活conda环境

1
$ conda activate your_r_env_name

从GitLab克隆R包

1
$ git clone https://github.com/mojaveazure/seurat-disk.git

安装R包

  • 仓库地址根据实际情况替换
1
$ Rscript -e "install.packages('./seurat-disk', repos = NULL, type = 'source')"
  • 可能会出现依赖问题
    • 根据提示安装,如:
    1
    conda install r-hdf5r

验证安装

1
library(SeuratDisk)